Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD4Q9NVD3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms