Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF19AQ9NV58 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF19AQ9NV58 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF19AQ9NV58 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms