Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms