Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RRP7BPQ9NSQ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms