Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms