Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC1Q9NRX5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC1Q9NRX5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms