Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6BQ9NRW1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms