Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms