Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR56

MBNL1, Muscleblind-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL1Q9NR56 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBNL1Q9NR56 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBNL1Q9NR56 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBNL1Q9NR56 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MBNL1Q9NR56 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MBNL1Q9NR56 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBNL1Q9NR56 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBNL1Q9NR56 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBNL1Q9NR56 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBNL1Q9NR56 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBNL1Q9NR56 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBNL1Q9NR56 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms