Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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