Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAC1Q9NQ79 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAC1Q9NQ79 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms