Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms