Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPCPD1Q9NPB8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms