Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms