Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNPLA8Q9NP80 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms