Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUFT1Q9NNX1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms