Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNRC6CQ9HCJ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms