Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms