Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC28A3Q9HAS3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC28A3Q9HAS3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms