Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms