Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Z3

PCIF1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCIF1Q9H4Z3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCIF1Q9H4Z3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCIF1Q9H4Z3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms