Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms