Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCAD1Q9H4L7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.1 ms