Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GANQ9H2C0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GANQ9H2C0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms