Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK2Q9H0K1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms