Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms