Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMBRA1Q9C0C7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms