Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX4Q9BYU1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX4Q9BYU1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PBX4Q9BYU1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms