Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF7Q9BWX1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF7Q9BWX1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms