Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM62Q9BVG3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms