Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF8Q9BRL6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms