Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms