Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPAT1Q99943 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPAT1Q99943 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms