Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3AQ99856 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms