Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAT1Q99536 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms