Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms