Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT8L2Q96SF2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms