Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBGCP6Q96RT7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms