Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE1Q96RT6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms