Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms