Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1Q96NA8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms