Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms