Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms