Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.6 ms