Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms