Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms