Protein–RNA interactions for Protein: Q96J84

KIRREL1, Kin of IRRE-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL1Q96J84 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIRREL1Q96J84 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms