Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZDHHC12Q96GR4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC12Q96GR4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms