Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCD1Q96GM5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms