Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTP4Q96DX8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms